應用舉例:蛋白質(zhì)組學研究方向流行的代謝標記方法是SILAC(Stable Isotope Labeling with Amino acids in Cell culture),即細胞培養(yǎng)中氨基酸的穩(wěn)定同位素標記。結(jié)合質(zhì)譜技術(shù),SILAC通過使用重型氨基酸(例如,15N-或13C-賴氨酸)標記其中一組培養(yǎng)物或細胞系,而向另一組添加正常的輕型氨基酸,從而量化兩種培養(yǎng)物或細胞系之間蛋白質(zhì)豐度的差異。然后將在這兩種條件下生長的細胞的裂解蛋白按細胞數(shù)或蛋白量等比例混合,經(jīng)分離、純化后進行質(zhì)譜鑒定,根據(jù)一級質(zhì)譜圖中兩個同位素型肽段的面積比較進行相對定量,得到兩種條件下蛋白質(zhì)豐度差異的相對評估。